Theo đó, bị can Đỗ Khắc Hưng bị khởi tố và áp dụng biện pháp cấm đi khỏi nơi cư trú để điều tra về tội Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ theo điều 356 Bộ luật hình sự 2015. Trong Kỳ thi Trung học phổ thông Quốc gia 2018 tại Sơn La, với nhiệm vụ được phân công là giữ chìa khóa và bảo vệ phòng chứa các bài thi, Đỗ Khắc Hưng đã thông đồng, tiếp tay cho một số đối tượng liên quan tới vụ án này bằng cách mở khóa phòng chứa các bài thi cho các đối tượng vào để sửa chữa điểm bài thi.

Trước đó, ngày 26-7-2018, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Sơn La đã khởi tố vụ án hình sự lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ xảy ra tại Hội đồng thi Trung học phổ thông Quốc gia tỉnh Sơn La năm 2018. Đến ngày 31-7-2018, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Sơn La ra quyết định khởi tố bị can đối với Trần Xuân Yến - Phó Giám đốc Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La; Nguyễn Thị Hồng Nga - Chuyên viên Phòng Khảo thí và Quản lý chất lượng, Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La; Đặng Hữu Thủy- Hiệu Phó trường THPT Tô Hiệu, Thành phố Sơn La; Cầm Thị Bun Sọn - Phó phòng Chính trị tư tưởng, Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La; Lò Văn Huynh - Trưởng phòng khảo thí - quản lý chất lượng giáo dục, Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La.

Ngày 22-8-2018, Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh Sơn La tiếp tục ra quyết định khởi tố bị can đối với Nguyễn Thanh Nhàn, Phó phòng khảo thí - quản lý chất lượng giáo dục, Sở giáo dục và đào tạo tỉnh Sơn La về tội Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ.

Cơ quan An ninh điều tra cũng ra lệnh bắt tạm giam đối với 3 bị can: Nguyễn Thị Hồng Nga, Đặng Hữu Thủy, Lò Văn Huynh; ra lệnh khám xét nơi ở, nơi làm việc đối với: Trần Xuân Yến, Nguyễn Thị Hồng Nga, Đặng Hữu Thủy, Cầm Thị Bun Sọn, Lò Văn Huynh, Nguyễn Thanh Nhàn; ra lệnh cấm đi khỏi nơi cư trú đối với: Trần Xuân Yến, Cầm Thị Bun Sọn và Nguyễn Thanh Nhàn.

Hiện vụ án đang được quan chức năng tỉnh Sơn La tiếp tục điều tra.